Il piano originale era quello di ripetere la sequenza più volte

  1. Correggere gli errori e rileggere. Il piano originale era quello di ripetere la sequenza fino a 12 volte per sfrondare gli errori che inevitabilmente accompagnano un progetto di 3,1 miliardi di pezzi datum. Nella fretta di fare l'annuncio congiunto, la Celera Genomics finanziati con fondi privati e il finanziamento pubblico del consorzio internazionale Progetto Genoma Umano costante temporaneamente, per meno della metà di tale obiettivo. Proofreading vorrà probabilmente un altro anno o due dalla data del bando.
  2. Riempire decine di migliaia di lacune nella sequenza. Questi buchi sono ammontate a circa il 15 per cento del genoma su 26 giugno 2000. Lacune più si trovano in tratti di brevi sequenze ripetute centinaia o migliaia di volte, il che li rende estremamente difficile da ottenere.
  3. Sequenza il sette per cento del genoma di Homo sapiens che è stato inizialmente escluse dal progetto. Questa regione è eterocromatina, DNA altamente concentrato lungo credere che contengano alcun geni. Ma nel marzo del 2000, l'analisi ha rivelato che eterocromatina mosca della frutta (circa un terzo del genoma della mosca) sembra contenere circa 50 eterocromatina Homo sapiens genesso probabilmente contiene alcuni geni, anche.
  4. Fine trovare tutti i geni che compongono le proteine. Questo passaggio avviene dopo la sequenza è pulita e ritenute accurate 99,99 per cento. Circa 38.000 geni che codificano proteine sono stati confermati finora. Recenti stime tendono a scendere al di sotto 60.000.
  5. Trova la proteina non-making geni. Ci sono, ad esempio, i geni che rendono RNA, piuttosto che di proteine. Essi tendono a scendere al di sotto della soglia del gene di oggi-software ricerca, nuovi modi di scoprire quali dovranno essere elaborate.
  6. Scoprire le sequenze regolatrici che attivano un gene e che regolano la quantità del suo prodotto di fare.
  7. Sbrogliare intricate interazioni geni 'con altre molecole.
  8. Identificare le funzioni dei geni. Perché un gene può produrre le proteine diverse, e ogni proteina può svolgere più di un lavoro, il compito sarà stupendo.

  

Come verificare ogni elemento dalla lista, i ricercatori saranno generare le informazioni che permetteranno di attaccare e anche prevenire una vasta gamma di Homo sapiens mali. Ma quanto tempo ci vorrà per ottenere la checklist? Se qualcuno lo sa, dovrebbe essere il presidente Celera Genomics J. Craig Venter. Il giorno di annuncio di Venter ha previsto che l'analisi terrà la maggior parte di questo secolo.

Trovare il genoma del Master Switch

Una volta che il Progetto Genoma Umano fornisce un elenco di tutti i nostri geni, il trucco successivo sarà cercare di capire che cosa fanno questi geni. Rendendo il lavoro un po 'più facile, però, è una nuova tecnica di DNA microarray sviluppata dagli scienziati del Whitehead Institute presso il Massachusetts Institute of Technology e Corning, Inc. Reporting nel dicembre 2000 del Scienza, Richard Young ei suoi colleghi svelare un metodo che individua in circa una settimana che i circuiti cellulari, che sono controllate da interruttori maestro nel compito genomea che prende di solito anni. "Siamo molto soddisfatti di questi risultati, perché suggeriscono che la nostra tecnica può essere utilizzata per creare un 'manuale' per i controlli della cella master, l'utente è un articlelet che corrisponde al master switch per i circuiti di controllo che nel genoma", ha dichiarato Bob Young.

Gli interruttori master sono in proteine, infatti, chiamati attivatori di geni, che si legano a specifiche regioni di DNA, o geni, e in tal modo, di avviare serie di passaggi che tutto il controllo della crescita cellulare e lo sviluppo di semina malattia gruppo. Young costruito il loro metodo di circa DNA microarrays, perché questi dispositivi permettono di adottare una sorta di istantanea di una cellula, e vedere quali geni sono accesi e quali siano spenti. Per i biologi, sapere quali geni sono attivi in una cellula svolge una qualche funzione è incredibilmente informazioni utili, come essere in grado di eguagliare le singole note in un accordo con il suono che producono. Ma non rivela che switchor master handplayed le note, e l'Homo sapiens genoma contiene circa 1.000 switch master. Fino ad oggi, gli scienziati sanno l'attività di solo un quarto di essi, come ad esempio la proteina p53, che svolge un ruolo nel cancro.

Il primo passo verso la nuova tecnica è che fissa le proteine interruttore generale in cellule viventi al loro DNA utilizzando siti di legame chimico methodssort reticolazione di incollaggio, come le mani per le chiavi sono sorprendenti. Gli scienziati hanno poi aperto le celle, la creazione di una zuppa di complessi proteina-DNA. Usano anticorpi con sfere magnetiche di trarre interessanti frammenti di DNA, con la proteina interruttore principale ancora attaccato. Avanti di isolare i frammenti di DNA, l'etichetta con tinture fluorescenti e ibridare ad un array di DNA che contiene il DNA genomico da lievito, che identifica ciò che sono. Come una prova del metodo, Young ei suoi colleghi hanno dimostrato che si può correttamente individuare i circuiti cellulare controllato da due interruttori maestro conosciuto. "Il nostro obiettivo è quello di utilizzare questa tecnica per trovare i circuiti controllati dagli interruttori a 200 o giù di lì master in lievito," Young, aggiunge, "e quindi sviluppare tecniche analoghe in sapienss Homo".

un articolo presentato dalla Donis F.


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