いくつかの企業のバイオインフォマティクスのツールを提供するために発芽して

前例のない派手出迎え 2000年6月26日発表は、科学者たちはヒトの草案サピエンスのゲノム配列を完成させた。真実は、しかし、その簡単な部分は我々の遺伝子のアルファベットの文字の順序を見つけ出すことです。今は、ハードなんだ：遺伝的命令の記事の意味を解読する。

次の段階で、一見平凡な名前：アノテーションで行く。厳密に言えば、"注釈"は、遺伝子について知られていることはすべて：ここで、その作品を、それは何をどのように仲間の遺伝子と相互作用する。現時点では、科学者たちはしばしば、単純に最初のステップ：遺伝子を見つけることを意味する用語を使用する構成されます。は、DNAのストレッチのどの部分を発見することを意味する遺伝子に属しており、他の96パーセントからそれらを区別するほどのことは、多くのジャンクDNAと呼ばれる機能を知っている。

いくつかの企業のバイオインフォマティクスのツール、ソフトウェア、およびサービスを提供するまで発芽している。彼らの成功というのは、平和的な場で南のヒンジ可能性がありますイングランドs'の大学のケンブリッジそれに家であるサンガーセンター、英国公的ヒトゲノムプロジェクト（HGP）出資コンソーシアムのパートナーは、欧州バイオインフォマティクス研究所（EBIの）ヨーロッパ'の等価掲載国立センターバイオ情報（NCBI）の国立衛生研究所のサンガーとEBIでは、Ensemblのプロジェクトでは、ゲノム解析やヒトのパブリックデータベースのためのコンピュータプログラムのサピエンスのDNA配列で構成され協力している。新たなDNA配列の断片に到着;自動化されたルーチンは、パターンは、通常遺伝子の発見さんのシーケンスをスキャンします。 "1つのEnsemblのについては、重要なことは、我々は完全にオープンしているので、すべてのデータは、絶対にすべてを"を参照することができますEBIとのユアンバーニーは言う。

どんなに自分たちのアルゴリズムは、コンピュータのすべての遺伝子を得ることができない、才能があり、それらすべての権利を取得することはできません。多くの追加や修正に加えて、すべての重要な情報をどのように遺伝子と規制されても何をすべきかについては、ヒトのタスクサピエンス学芸員です。この問題を解決Ensemblのためのリンカーンスタインコールドスプリングハーバー研究所が開発中の分散コンピューティングシステム上で解決される可能性がありますロングアイランド、ニューヨーク計画の科学者たちからのホモサピエンスannotationcorrectionsと提案し、研究成果を提供することであるEnsemblのの自動アノテーションの上にworldlayered。スタインの分散処理注釈情報システム、DASの短いのは、論争のソフトウェアは、人々がインターネット上で音楽ファイルを交換することができますナップスターからのアプローチを借りている。

計画では、別のラボの専用サーバー（）に独自の注釈を公開する予定のいくつかの一般的に受け入れ、マップの仕様によるとされているgenomelike Ensemblのだ。 "それから、ブラウザアプリケーションは、Web、上に何があるか、すべての統合されたビューにはそれがあなたのさまざまな人々は、ゲノムの特定の領域については、"と言っていたグラフィカルな方法で見ることが持ってきて見つける外出できるようになるシュタインについて説明します。 DASは、巨大な問題を解決することがありますこの方法では、伝染病学のデータベース：アーカイブとは、他の欠点のうち、それら全体を検索し、内容を比較することは不可能になりますデータを提示するための標準的なフォーマットの欠けている。

DASモデル普遍的に愛されていません。 NCBI監督のデビッドリップマンので、ピアレビューされませんは、ホモサピエンスの注釈ごみの完全な可能性を懸念されます。スタインの可能性を認めながらも、良い注釈が悪いドライブを願っています。彼かどうか、ボランティアの精神にフラグが人事、資金調達の気まぐれに直面して心配です。研究室のWebサーバーを実行して維持、最新の長期的なコミットメントです。

として、ヒトゲノム計画と個人所有のセレラジェノミクス社の間で広く知られるライバルのゲノムは、多くのバイオインフォマティクス企業のビートに組織としてEnsemblの関係はありませんシーケンスに反対した。実際には、いくつかの商用の選手の協力を支持する、金融機会を独特の方法でデータを使用してから施行されます。ジェームズ一ギャレルス、プロテオームの社長にビバリー、マサチューセッツ州、と提携することを期待し、パブリックドメインの努力を各遺伝子の基本的な説明を積むために支援を提供し、そのタンパク質とタンパク質のキーのプロパティをいくつか。しかし、プロテオーム解析も何もサピエンスゲノムは広大で、多彩なヒトの感覚を行うための広大な多目的なホモサピエンスの脳ビートを考えている。同社の研究者、proteinsthe製品の大部分の遺伝子makeand集中し、1995年からの3つのモデル生物：線虫のタンパク質データベースを構築している文献を探し回る 線虫Caenorhabditis elegans と酵母の2種。今、彼らはホモサピエンス、マウス、ラットのゲノム上のデータを追加している。同社のニッチなすべての情報を統合されます。"それは努力をパブリックドメインに意図のタイプではない"と、ギャレルス指摘する。

プロテオーム解析の強みは、顧客の能力の種間の遺伝子配列を比較するには、うそをつく可能性が高いです。ので、進化は、非常に多くの遺伝子を保存して、それらを繰り返し使用すると、このような比較のヒントを豊富な情報源：ホモサピエンスの遺伝子を持つジョブの現在、多くの場合、ほぼ他の種の1つが存在すると同じになります謎です。

ランディスコットは、インサイトジェノミクスの社長にパロアルト、カリフォルニア州は、負荷を共有する別のファンです。加えて、"あるお金を稼ぐ方法はたくさんだ"とスコットを宣言します。 "我々は広く注釈されるデータベースは、パブリックドメインで利用できる予定しており、早ければ早いほど存在すると仮定して、高速なインサイト下流に、どのように情報を新たなレベルを作成するための情報を取るに焦点を当てることができます。"たとえば、企業診断、および他のアプリケーションで重要になると、遺伝子のそれと考えているグループを取り上げている彼らに、その注釈努力を集中している。また、データベースは、いくつかの種間比較を許可しています。

Ensemblのオープンソースコード、注釈と決意を無料配布し、ご滞在を考えれば、無料のLinuxコンピュータのオペレーティングsystemwhichとの比較いつかは、Microsoft Windowsのsupremacyare自然な挑戦があります。しかし、パラレル、非常に遠くに行っていません。公共施設や商業注釈製品のことを考えるのライバルとしてポイントのミスとみられる。のショーン渦の言葉ではワシントン大学人ダースに取り組んでいる："ホモサピエンスのゲノムも、誰にとっても人を見て大きい。我々は、公共および民間セクターの共同ではなく、競争力よりも仕事をする方法を考え出す必要になるだろう。"

記事Donis女性が提出した

免責事項：弊社のウェブサイトは、この資料の内容については責任を負いません。 Webarticles無料の情報リソースです。
重要： この記事は、"いくつかの企業が"自動ソフトウェアによって翻訳されたバイオインフォマティクスのツールを提供するために発芽している。大変申し訳ございませんが発生した可能性があります任意のスペルミスを感じている。お客様のご理解いただき、ありがとうございます。